横琴口岸及综合交通枢纽开发工程项目位于横琴岛十字门水道西岸横琴口岸旧址，与澳门一桥相连，处于“一国两制”的交汇点和“内外辐射”的结合部。该项目是广东省重点工程，按照国务院批复的《横琴总体发展规划》要求，将打造成为“模式创新、通关便捷、设施齐备”的国内一流口岸，建成后将成为促进澳门经济适度多元化发展的重要窗口，将成为促进珠海以及珠江口西岸地区发展、促进粤港澳深度合作的新平台。
横琴口岸及综合交通枢纽开发工程位于功能区中部，建设用地范围面积为34.5公顷。项目总建筑面积约131万㎡，总投资约260亿元。整个项目集口岸通关、交通枢纽、商务配套三大功能于一体。
口岸通关
横琴口岸为国际一类口岸，采取“合作查验、一次放行”创新通关模式，融入澳门莲花口岸的查验功能，在珠澳双方深化合作的基础上实现在横琴口岸一地完成所有查验手续，旅客、车辆只需排一次队即可通关。
横琴口岸建成后预计到2030年的通关量：
旅客
- 日通关量
- 22.5万人次
- 年通关量
- 8228万人次
车辆
- 客车日通关量双向
- 2.41万车次
- 年通关量
- 723万车次
货运
- 货车年通关量
- 21.19万车次
交通枢纽
通过多层面、立体化的交通体系建设，在形式上实现了轨道交通、机动车交通、步行交通、静态交通间的无缝隙转化。
横琴侧主要解决广珠城际、公交、长途、出租车、旅游巴士、社会车辆、行人七大流线，以三纵两横的井字形道路形成内部体系，通过南北交通枢纽平台连接旅检大厅，通过换乘通道衔接广珠城际，通过长途汽车站和公交车站等连接汽运公交，通过地下空间联络口岸周边地块。
澳门侧主要解决澳门轻轨、公交、出租车、旅游巴士、社会车辆等五大流线，主要通过莲花大桥完成与澳门岛陆路连接，同时通过查验场匝道桥为澳大建设第二通道，通过相关地下工程的建设为澳门轻轨未来进入横琴预留站线建设条件。
多轨道串联，零距离接驳，开启琴澳轻轨时代横琴口岸引入以公共交通、轨道交通为主导的交通疏解概念，建立立体化、多层面 的交通体系。
出入境分层设计，多种交通形式“一站式”换乘。便捷明晰的换乘流线， 实现无缝换乘和便捷通关。
负一层为长途汽车、出租车接送换乘平台，负二层为轻轨换乘站及停车场，负三层为停车场，目前开放的停车位约 2500 个，均分布在负二和负三层。
商务配套
与口岸同步建设写字楼、公寓、酒店、影院、会议中心、购物中心等综合商务配套，旨在完善口岸配套服务设施，提升口岸整体服务品质，创新口岸与地块开发联合的运营机制，建设以粤澳合作为背景、口岸为载体、自贸产业为先导、便捷交通为保障的新型口岸综合开发项目。
